紫鹤（陈天文 饰）和萧瑶（叶素梅 饰）约定退隐江湖，过离群索居的日子，然而，就在他们准备离开之时，紫鹤的师傅却将武当派掌门人的位子传给了紫鹤，悲愤的萧瑶自觉遭到了背叛，一怒之下，她创立了白莲教，与紫鹤势不两立，并与他定下了五年之约，五年后进行决战。 云飞（曹国辉 饰）的母亲被慕容家逼死，成年之后，他遇见了名为如烟（潘玲玲 饰）的女子，与此同时，云飞同母异父的兄弟天峰（陈泰鸣 饰）亦在追求着如烟。还珠爱上了善良正直的云飞，而还珠的父亲却是野心勃勃企图谋权逆反的镇南王。五年一晃眼就过去了，当紫鹤和萧瑶双双在决战中死去之时，云飞竟然成为了嫌疑最大的罪魁祸首。
故事发生在1896年的纽约，那时的纽约一片繁荣景象，一边是科技的长足进步，一边是贫富差距的加剧。这时发生了一连串男童妓被残忍杀害的事件，新任警察局长（日后的第26任美国总统）西奥多·罗斯福找来了犯罪心理学家拉兹洛·克莱斯勒、记者约翰·摩尔去秘密调查。他们并非孤军奋战，时任局长秘书（日后成为首位女警探）莎拉·霍华德组织了一个行动小组，利用心理学和新兴的法医学，抽丝剥茧，去抓捕这个连环杀手。
专注各种大案要案的警视厅刑事部搜查一课，这一次迎来了一名非同寻常的新人藤堂比奈子（波瑠 饰）。藤堂具有过目不忘的惊人记忆力，历年所发生过的各种恶性案件她都熟稔非常，甚至总能在关键时刻从脑中的资料库里提取有效信息协助破案。和她搭档的东海林泰久（横山裕 饰）也同样是个不走寻常路的刑警，为了破案他不惜使用非法手段，而当年一段黑色经历让他变得愤世嫉俗。东海林发现，藤堂对杀人案——尤其是变态猎奇杀人案有着近乎病态的兴趣。 朋友之死她无动于衷，为了查案甚至敢于和罪犯近距离接触。难不成她本身就享受身处犯罪中心的快乐？
